Depuis un an déjà, le Stargate, la porte spatio-temporelle qui a permis au colonel O'Neil et à son équipe de découvrir la planète Abydos, dort dans un entrepôt de l'armée américaine. Trop dangereux ! ont décrété les autorités. Désormais, toute communication entre ces deux mondes est interdite. Mais un jour, la Porte s'ouvre de nouveau et ; issu du fin fond de la galaxie, surgissent des êtres malfaisants. Afin de les affronter, Jack O'Neil doit former une seconde expédition avec l'aide de son ami, le scientifique Daniel Jackson. Et dans un monde inconnu peuplé de créatures étranges, les deux hommes découvriront le comble de l'horreur...